記事や添付ファイル等のデータとDBがバックアップ対象となります。

ファイル： /var/share/joruri
DB： joruri_production

バックアップに関しては方法は色々あると思いますが
対象のフォルダとdumpファイルがコピーされていれば復旧可能です。

ex）
ファイル： cp -arp /var/share/joruri /var/share/joruri-bk
DB： mysqldump -u root -p joruri_production > joruri_production.dmp